一站式分子建模
与结构药物设计工作站

MolStudio 将交互式 3D 视口、分子 表格 / 卡片视图、2D 结构编辑器、 绘图器与 应用中心(准备、AutoDock Vina 对接、构象生成、相互作用与骨架/MMP 分析) 整合到一个可停靠的桌面工作区中,支持会话保存与工作区恢复。

29+
功能模块
10
应用中心工具
7 天
免费试用
100%
离线运行
核心能力

为结构药物设计而生的完整工作台

从分子导入、3D 可视化到对接与分析,所有编辑器共享同一数据模型,实时联动。

🧊

3D 视口

蛋白 / 配体渲染,多种风格(standard、toon、flat、outline、gooch),距离雾效、原子 / 残基拾取、序列查看器、Ramachandran 图与 2D 相互作用图。

📊

分子表格

分组分子浏览器,属性列、分组直方图、星标标记,与 3D 场景及卡片视图实时同步;支持计算列、过滤与去重。

🗂️

分子卡片视图

基于卡片的网格 / 树 / 力导向图布局,展示 2D 结构式、属性雷达图与热力着色边框,适合大量分子的可视化浏览。

✏️

2D 结构编辑器

Ketcher 风格画布,绘制 / 编辑 SMILES,元素与环模板、键型与电荷工具,支持约束构象生成与芳香性处理。

🎯

分子对接

集成 AutoDock Vina,可停靠的 3D 网格盒、Pick-from-3D 中心拾取、虚拟筛选模式,构象与亲和力结果回写表格。

📈

绘图编辑器

基于 Matplotlib 的交互式图表:分面、注释、动画与多格式导出(PNG / SVG / PDF),支持 HiDPI 与主题跟随。

💾

会话管理

单文件 .ms 会话,包含分子数据、停靠布局、勾选状态与 3D 视图;支持周期自动保存与崩溃恢复。

应用中心

应用中心 · 从准备到分析

按类别组织的工具面板,参数区与结果区并排,长任务带进度条与取消,结果可一键回写表格或工作区。

准备

  • Receptor Prep受体准备:最大片段、去水 / 离子 / 小配体、加氢、MMFF 最小化
  • Ligand Prep配体准备:中和、片段分离、加氢、ETKDG / MMFF 最小化

模拟

  • DockingAutoDock Vina 对接,网格盒与虚拟筛选
  • Conformers构象系综:ETKDG / MMFF / UFF、RMSD 去冗余、能量窗口

分析

  • InteractionsPLIP 风格接触检测:氢键 / 盐桥 / π-堆积 / 卤键等
  • ClusterButina 聚类 + 多样性挑选、Morgan 指纹、Tanimoto 矩阵
  • ScaffoldBemis-Murcko / 通用骨架、侧链频率、R-group 矩阵、SAR 热图
  • MMP匹配分子对:转化规则统计、置信区间、t 检验、FDR 校正

生成

  • CombinatorialBRICS 片段生长、性质 / 新颖性约束、Pareto 进化、收敛曲线
价格与授权

简单透明的授权方案

个人商业授权为一次性永久授权;个人非商用与教育科研可免费使用功能受限版。所有版本均含 7 天免费试用。

免费版

个人非商用 · 教育科研
免费 功能受限 · 仅限非商用
  • 基础功能:3D 视口 / 2D 编辑器 / 单分子对接
  • 单会话分子数上限(≤ 100 个)
  • 不含虚拟筛选 / 组合生成 / MMP / 构象 / 聚类 / 骨架 / 卡片 Tree·Graph 布局等高级工具
  • 仅限非商用,商业用途需购买商用授权
免费下载
省钱

两件套

MolStudio + MolInsight · 各 1 台机器
¥1,299 两套永久授权 · 省 ¥299
  • MolStudio 个人商用授权(永久)
  • MolInsight 个人商用授权(永久)
  • 各自绑定 1 台机器,支持离线激活
  • 比分开买省 ¥299,含邮件支持
购买两件套

所有版本均含 7 天免费试用(试用期内全功能);免费版为功能受限版,面向个人非商用与教育科研;商用版为一次性永久授权,含邮件支持。

含 v1.x 全部更新;未来大版本(v2.0)单独发布,老客户升级价 ¥499。国内购买渠道暂未开放,如需商用授权请邮件联系。

下载

下载 MolStudio v1.0

下载 Windows / Linux 版本,几分钟内开始你的分子建模工作流。

🪟

MolStudio v1.0(Windows)

Windows 10 / 11 · 64 位 · 安装向导 · 78 MB

桌面应用安装包,内置 AutoDock Vina 与运行所需的全部组件;安装完成后即可从开始菜单或桌面快捷方式启动,无需单独配置 Python 环境。

⤓ 下载安装程序 (.exe)
🐧

MolStudio v1.0(Linux)

Linux x86_64 · glibc 2.35+ (Ubuntu 22.04+ / Debian 12+) · tar.gz · 162 MB

Linux 构建包,解压后 chmod +x MolStudio 即可运行;内置 AutoDock Vina。极简安装若提示缺少 Qt 平台插件,执行 sudo apt install libxcb-cursor0 libgl1。

⤓ 下载 Linux 版 (.tar.gz)

系统要求

操作系统Windows 10 / 11 · Linux (x86_64)
对接Windows / Linux 内置 AutoDock Vina
授权首次运行自动授予 7 天试用,可离线授权

安装步骤

第 1 步选择你的平台并下载安装包
第 2 步Windows 双击 MolStudio-Setup-v1.0.exe;Linux 解压后 chmod +x MolStudio
第 3 步按提示完成安装并启动 MolStudio
试用首次运行自动授予 7 天试用期,可离线授权